Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms