Protein–RNA interactions for Protein: Q13404

UBE2V1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2V1Q13404 AC135050.1-201ENST00000622229 3380 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 OPRK1-201ENST00000265572 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 CACNA1G-208ENST00000442258 7226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 MICAL2-201ENST00000256194 3906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 TF-201ENST00000402696 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 SLC25A25-205ENST00000432073 3678 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 HDLBP-214ENST00000427183 6238 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 BIVM-ERCC5-204ENST00000639132 5195 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 RNF220-202ENST00000355387 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 SNCAIP-222ENST00000542191 2729 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 FAM95B1-201ENST00000455995 4236 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 KIZ-213ENST00000620891 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 CASC15-204ENST00000606197 3969 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 EXOC8-201ENST00000366645 5100 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 PDK2-216ENST00000614357 2493 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 DAO-201ENST00000228476 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 AC105402.3-202ENST00000446781 2592 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 KCNMA1-227ENST00000638203 3840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 TCF3-202ENST00000344749 4289 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 LRPPRC-201ENST00000260665 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 PITRM1-201ENST00000224949 3450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 AC010336.1-201ENST00000539278 4739 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 FAM105A-201ENST00000274217 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 IKBKE-203ENST00000581977 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 ARID4A-206ENST00000431317 5783 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 USP30-201ENST00000257548 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 KCNMA1-208ENST00000372440 3849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC10.34□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 KCNMA1-233ENST00000638351 3849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 F2-205ENST00000530231 1849 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 LINC00384-201ENST00000437721 6852 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 DNAI2-202ENST00000446837 2474 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 TMCC2-208ENST00000545499 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 A1CF-204ENST00000373997 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 RAB6A-202ENST00000336083 3085 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 GPR173-201ENST00000332582 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 PRKCQ-201ENST00000263125 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 FILIP1L-203ENST00000383694 3280 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 ARL4C-201ENST00000339728 3385 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 FAM102A-203ENST00000373095 4144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 PLAT-201ENST00000220809 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 FRMD4B-201ENST00000398540 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 AC141928.1-201ENST00000511928 4525 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 DERL3-203ENST00000404056 3113 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 LRRN2-201ENST00000367175 5036 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 AGAP12P-201ENST00000585227 2359 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 ESPNL-203ENST00000409506 3610 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 SEPT9-204ENST00000427180 3635 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 BCL2L13-214ENST00000543133 4975 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 BCL2L13-217ENST00000618481 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 KLHL32-206ENST00000544166 2864 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 GUCY2EP-203ENST00000531117 1918 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 LRRC15-201ENST00000347624 5883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 ARHGAP45-203ENST00000543365 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 SEMA6D-202ENST00000354744 5931 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 ZNF302-203ENST00000457781 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 DOCK4-204ENST00000428084 7997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 YTHDC1-201ENST00000344157 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 TP73-203ENST00000357733 4899 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 SLC3A1-202ENST00000409229 2909 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.9 ms