Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 TCERG1L-AS1-201ENST00000436942 472 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 AL020996.1-201ENST00000442055 435 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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