Protein–RNA interactions for Protein: Q08554

DSC1, Desmocollin-1, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC1Q08554 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DSC1Q08554 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms