Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99 ms