Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CHRNB3Q05901 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CHRNB3Q05901 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
CHRNB3Q05901 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
CHRNB3Q05901 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CHRNB3Q05901 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CHRNB3Q05901 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CHRNB3Q05901 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CHRNB3Q05901 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CHRNB3Q05901 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CHRNB3Q05901 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CHRNB3Q05901 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CHRNB3Q05901 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CHRNB3Q05901 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
CHRNB3Q05901 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
CHRNB3Q05901 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
CHRNB3Q05901 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
CHRNB3Q05901 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
CHRNB3Q05901 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
CHRNB3Q05901 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
CHRNB3Q05901 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
CHRNB3Q05901 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
CHRNB3Q05901 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
CHRNB3Q05901 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
CHRNB3Q05901 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CHRNB3Q05901 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CHRNB3Q05901 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CHRNB3Q05901 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CHRNB3Q05901 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CHRNB3Q05901 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CHRNB3Q05901 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CHRNB3Q05901 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CHRNB3Q05901 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
CHRNB3Q05901 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
CHRNB3Q05901 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CHRNB3Q05901 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CHRNB3Q05901 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CHRNB3Q05901 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CHRNB3Q05901 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CHRNB3Q05901 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CHRNB3Q05901 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CHRNB3Q05901 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CHRNB3Q05901 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CHRNB3Q05901 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CHRNB3Q05901 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CHRNB3Q05901 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
CHRNB3Q05901 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CHRNB3Q05901 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CHRNB3Q05901 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CHRNB3Q05901 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CHRNB3Q05901 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CHRNB3Q05901 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CHRNB3Q05901 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CHRNB3Q05901 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CHRNB3Q05901 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CHRNB3Q05901 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CHRNB3Q05901 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CHRNB3Q05901 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CHRNB3Q05901 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHRNB3Q05901 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHRNB3Q05901 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHRNB3Q05901 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHRNB3Q05901 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHRNB3Q05901 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHRNB3Q05901 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHRNB3Q05901 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHRNB3Q05901 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHRNB3Q05901 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHRNB3Q05901 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHRNB3Q05901 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHRNB3Q05901 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
CHRNB3Q05901 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHRNB3Q05901 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHRNB3Q05901 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHRNB3Q05901 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHRNB3Q05901 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHRNB3Q05901 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHRNB3Q05901 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHRNB3Q05901 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHRNB3Q05901 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHRNB3Q05901 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHRNB3Q05901 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHRNB3Q05901 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHRNB3Q05901 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHRNB3Q05901 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHRNB3Q05901 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHRNB3Q05901 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHRNB3Q05901 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHRNB3Q05901 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHRNB3Q05901 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHRNB3Q05901 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHRNB3Q05901 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHRNB3Q05901 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHRNB3Q05901 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHRNB3Q05901 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHRNB3Q05901 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
CHRNB3Q05901 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHRNB3Q05901 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHRNB3Q05901 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHRNB3Q05901 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms