Protein–RNA interactions for Protein: Q03989

ARID5A, AT-rich interactive domain-containing protein 5A, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID5AQ03989 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms