Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms