Protein–RNA interactions for Protein: P61586

RHOA, Transforming protein RhoA, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOAP61586 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHOAP61586 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHOAP61586 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHOAP61586 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHOAP61586 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHOAP61586 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHOAP61586 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHOAP61586 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHOAP61586 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHOAP61586 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHOAP61586 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHOAP61586 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHOAP61586 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHOAP61586 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHOAP61586 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHOAP61586 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHOAP61586 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHOAP61586 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RHOAP61586 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHOAP61586 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHOAP61586 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHOAP61586 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHOAP61586 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RHOAP61586 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RHOAP61586 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHOAP61586 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHOAP61586 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHOAP61586 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHOAP61586 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHOAP61586 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHOAP61586 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHOAP61586 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RHOAP61586 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHOAP61586 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHOAP61586 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHOAP61586 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHOAP61586 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHOAP61586 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHOAP61586 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHOAP61586 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHOAP61586 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHOAP61586 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHOAP61586 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHOAP61586 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHOAP61586 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RHOAP61586 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RHOAP61586 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHOAP61586 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RHOAP61586 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHOAP61586 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHOAP61586 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHOAP61586 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHOAP61586 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHOAP61586 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RHOAP61586 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHOAP61586 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHOAP61586 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHOAP61586 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHOAP61586 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHOAP61586 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHOAP61586 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHOAP61586 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHOAP61586 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHOAP61586 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHOAP61586 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHOAP61586 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHOAP61586 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RHOAP61586 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHOAP61586 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHOAP61586 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHOAP61586 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHOAP61586 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHOAP61586 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHOAP61586 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHOAP61586 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHOAP61586 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHOAP61586 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHOAP61586 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHOAP61586 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHOAP61586 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHOAP61586 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHOAP61586 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHOAP61586 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHOAP61586 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHOAP61586 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHOAP61586 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHOAP61586 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHOAP61586 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHOAP61586 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHOAP61586 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHOAP61586 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHOAP61586 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHOAP61586 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHOAP61586 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHOAP61586 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHOAP61586 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHOAP61586 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHOAP61586 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHOAP61586 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHOAP61586 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms