Protein–RNA interactions for Protein: P55145

MANF, Mesencephalic astrocyte-derived neurotrophic factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MANFP55145 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC14.24□□□□□ -0.13
MANFP55145 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
MANFP55145 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
MANFP55145 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
MANFP55145 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
MANFP55145 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
MANFP55145 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
MANFP55145 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
MANFP55145 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
MANFP55145 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
MANFP55145 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
MANFP55145 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
MANFP55145 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
MANFP55145 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
MANFP55145 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
MANFP55145 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
MANFP55145 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
MANFP55145 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
MANFP55145 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
MANFP55145 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
MANFP55145 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
MANFP55145 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
MANFP55145 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
MANFP55145 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
MANFP55145 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
MANFP55145 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
MANFP55145 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
MANFP55145 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
MANFP55145 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
MANFP55145 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
MANFP55145 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
MANFP55145 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
MANFP55145 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
MANFP55145 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
MANFP55145 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
MANFP55145 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
MANFP55145 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
MANFP55145 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
MANFP55145 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
MANFP55145 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC14.23□□□□□ -0.13
MANFP55145 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
MANFP55145 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
MANFP55145 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
MANFP55145 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
MANFP55145 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
MANFP55145 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
MANFP55145 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
MANFP55145 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
MANFP55145 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
MANFP55145 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
MANFP55145 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
MANFP55145 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
MANFP55145 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
MANFP55145 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
MANFP55145 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
MANFP55145 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
MANFP55145 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
MANFP55145 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
MANFP55145 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
MANFP55145 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
MANFP55145 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
MANFP55145 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
MANFP55145 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
MANFP55145 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
MANFP55145 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
MANFP55145 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
MANFP55145 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
MANFP55145 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
MANFP55145 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
MANFP55145 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
MANFP55145 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
MANFP55145 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
MANFP55145 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
MANFP55145 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
MANFP55145 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
MANFP55145 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
MANFP55145 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
MANFP55145 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
MANFP55145 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
MANFP55145 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
MANFP55145 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
MANFP55145 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
MANFP55145 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
MANFP55145 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
MANFP55145 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
MANFP55145 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
MANFP55145 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
MANFP55145 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
MANFP55145 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
MANFP55145 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC14.22□□□□□ -0.13
MANFP55145 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC14.22□□□□□ -0.13
MANFP55145 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
MANFP55145 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
MANFP55145 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC14.22□□□□□ -0.13
MANFP55145 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
MANFP55145 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
MANFP55145 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
MANFP55145 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.22□□□□□ -0.13
MANFP55145 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
MANFP55145 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms