Protein–RNA interactions for Protein: P55107

GDF10, Growth/differentiation factor 10, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF10P55107 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GDF10P55107 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GDF10P55107 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GDF10P55107 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GDF10P55107 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GDF10P55107 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GDF10P55107 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GDF10P55107 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GDF10P55107 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GDF10P55107 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GDF10P55107 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GDF10P55107 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GDF10P55107 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GDF10P55107 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GDF10P55107 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GDF10P55107 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GDF10P55107 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GDF10P55107 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GDF10P55107 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GDF10P55107 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GDF10P55107 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GDF10P55107 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GDF10P55107 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GDF10P55107 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GDF10P55107 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GDF10P55107 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GDF10P55107 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GDF10P55107 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GDF10P55107 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GDF10P55107 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GDF10P55107 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GDF10P55107 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GDF10P55107 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GDF10P55107 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GDF10P55107 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GDF10P55107 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GDF10P55107 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GDF10P55107 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GDF10P55107 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GDF10P55107 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GDF10P55107 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GDF10P55107 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GDF10P55107 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GDF10P55107 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GDF10P55107 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GDF10P55107 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GDF10P55107 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GDF10P55107 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GDF10P55107 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GDF10P55107 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GDF10P55107 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GDF10P55107 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GDF10P55107 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GDF10P55107 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GDF10P55107 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GDF10P55107 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GDF10P55107 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GDF10P55107 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GDF10P55107 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GDF10P55107 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GDF10P55107 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GDF10P55107 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GDF10P55107 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GDF10P55107 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GDF10P55107 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GDF10P55107 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GDF10P55107 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GDF10P55107 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GDF10P55107 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GDF10P55107 YIPF7-202ENST00000415895 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GDF10P55107 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GDF10P55107 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GDF10P55107 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GDF10P55107 AC084149.2-201ENST00000438443 797 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GDF10P55107 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GDF10P55107 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GDF10P55107 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GDF10P55107 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GDF10P55107 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GDF10P55107 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GDF10P55107 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GDF10P55107 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GDF10P55107 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GDF10P55107 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GDF10P55107 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GDF10P55107 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GDF10P55107 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GDF10P55107 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GDF10P55107 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GDF10P55107 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GDF10P55107 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GDF10P55107 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GDF10P55107 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GDF10P55107 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GDF10P55107 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GDF10P55107 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GDF10P55107 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GDF10P55107 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GDF10P55107 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GDF10P55107 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms