Protein–RNA interactions for Protein: P48645

NMU, Neuromedin-U, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMUP48645 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
NMUP48645 BIRC5-202ENST00000350051 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
NMUP48645 TRIM35-201ENST00000305364 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
NMUP48645 SMTN-203ENST00000358743 3198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
NMUP48645 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
NMUP48645 EXOC3-201ENST00000315013 2682 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
NMUP48645 SEZ6L-201ENST00000248933 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
NMUP48645 SEZ6L-210ENST00000629590 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
NMUP48645 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
NMUP48645 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
NMUP48645 ALOX15B-202ENST00000380183 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
NMUP48645 RAB37-205ENST00000392614 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
NMUP48645 VENTXP1-201ENST00000569334 2716 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
NMUP48645 TGM1-201ENST00000206765 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
NMUP48645 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
NMUP48645 CTDP1-202ENST00000299543 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
NMUP48645 ZBTB20-206ENST00000464560 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
NMUP48645 ZBTB49-201ENST00000337872 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
NMUP48645 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
NMUP48645 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
NMUP48645 ARHGEF4-217ENST00000611048 3486 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
NMUP48645 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
NMUP48645 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
NMUP48645 ZEB2-246ENST00000638128 8932 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
NMUP48645 KCNJ10-201ENST00000368089 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
NMUP48645 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
NMUP48645 DCAF6-201ENST00000312263 3186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
NMUP48645 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
NMUP48645 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
NMUP48645 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
NMUP48645 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
NMUP48645 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
NMUP48645 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
NMUP48645 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
NMUP48645 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
NMUP48645 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
NMUP48645 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
NMUP48645 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
NMUP48645 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
NMUP48645 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
NMUP48645 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
NMUP48645 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
NMUP48645 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
NMUP48645 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
NMUP48645 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
NMUP48645 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
NMUP48645 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
NMUP48645 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
NMUP48645 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
NMUP48645 OPLAH-204ENST00000618853 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
NMUP48645 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
NMUP48645 SERBP1-204ENST00000370995 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
NMUP48645 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
NMUP48645 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
NMUP48645 PERP-201ENST00000421351 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
NMUP48645 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
NMUP48645 TNFRSF21-201ENST00000296861 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
NMUP48645 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
NMUP48645 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
NMUP48645 SLC5A9-210ENST00000533824 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
NMUP48645 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
NMUP48645 ZNF721-205ENST00000511833 2966 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.73□□□□□ -0.69
NMUP48645 KIAA1549-202ENST00000440172 12379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
NMUP48645 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
NMUP48645 RAB40A-202ENST00000372633 3126 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
NMUP48645 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
NMUP48645 HNRNPDL-207ENST00000614627 3968 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
NMUP48645 ZNF75D-202ENST00000370766 5592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
NMUP48645 RBM10-201ENST00000329236 3201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
NMUP48645 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
NMUP48645 RAP1GAP2-201ENST00000254695 6661 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
NMUP48645 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
NMUP48645 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
NMUP48645 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
NMUP48645 VWA8-203ENST00000379310 7147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
NMUP48645 STRN-201ENST00000263918 8168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
NMUP48645 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
NMUP48645 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
NMUP48645 NTRK2-203ENST00000323115 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
NMUP48645 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
NMUP48645 PRKN-205ENST00000366897 2877 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
NMUP48645 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
NMUP48645 ICOSLG-202ENST00000400377 2907 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
NMUP48645 RPGRIP1-202ENST00000400017 3940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
NMUP48645 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
NMUP48645 TRIM46-205ENST00000392451 3195 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
NMUP48645 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
NMUP48645 IKZF1-211ENST00000440768 5511 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
NMUP48645 PSMD12-201ENST00000356126 4406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
NMUP48645 TRIM4-201ENST00000349062 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
NMUP48645 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
NMUP48645 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
NMUP48645 ATXN2L-201ENST00000325215 3788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
NMUP48645 ARHGAP45-203ENST00000543365 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
NMUP48645 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
NMUP48645 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
NMUP48645 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
NMUP48645 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
NMUP48645 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
NMUP48645 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms