Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 DLX3-201ENST00000434704 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 CARHSP1-217ENST00000611932 2833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 COPS7B-203ENST00000373608 2563 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms