Protein–RNA interactions for Protein: P34897

SHMT2, Serine hydroxymethyltransferase, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHMT2P34897 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SHMT2P34897 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SHMT2P34897 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SHMT2P34897 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SHMT2P34897 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SHMT2P34897 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SHMT2P34897 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SHMT2P34897 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SHMT2P34897 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SHMT2P34897 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SHMT2P34897 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SHMT2P34897 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SHMT2P34897 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SHMT2P34897 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SHMT2P34897 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SHMT2P34897 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SHMT2P34897 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SHMT2P34897 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SHMT2P34897 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SHMT2P34897 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SHMT2P34897 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SHMT2P34897 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SHMT2P34897 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SHMT2P34897 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SHMT2P34897 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SHMT2P34897 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SHMT2P34897 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SHMT2P34897 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SHMT2P34897 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SHMT2P34897 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SHMT2P34897 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SHMT2P34897 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SHMT2P34897 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SHMT2P34897 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SHMT2P34897 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SHMT2P34897 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SHMT2P34897 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SHMT2P34897 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SHMT2P34897 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SHMT2P34897 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SHMT2P34897 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SHMT2P34897 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SHMT2P34897 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SHMT2P34897 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SHMT2P34897 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SHMT2P34897 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SHMT2P34897 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SHMT2P34897 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SHMT2P34897 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SHMT2P34897 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SHMT2P34897 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SHMT2P34897 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SHMT2P34897 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SHMT2P34897 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SHMT2P34897 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SHMT2P34897 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SHMT2P34897 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SHMT2P34897 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SHMT2P34897 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SHMT2P34897 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SHMT2P34897 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SHMT2P34897 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SHMT2P34897 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SHMT2P34897 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SHMT2P34897 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SHMT2P34897 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SHMT2P34897 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SHMT2P34897 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SHMT2P34897 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SHMT2P34897 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SHMT2P34897 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SHMT2P34897 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SHMT2P34897 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SHMT2P34897 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SHMT2P34897 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SHMT2P34897 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SHMT2P34897 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SHMT2P34897 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SHMT2P34897 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SHMT2P34897 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SHMT2P34897 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SHMT2P34897 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SHMT2P34897 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SHMT2P34897 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SHMT2P34897 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SHMT2P34897 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SHMT2P34897 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SHMT2P34897 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SHMT2P34897 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SHMT2P34897 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SHMT2P34897 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SHMT2P34897 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SHMT2P34897 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SHMT2P34897 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SHMT2P34897 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SHMT2P34897 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SHMT2P34897 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SHMT2P34897 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SHMT2P34897 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SHMT2P34897 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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