Protein–RNA interactions for Protein: P30511

HLA-F, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain F, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-FP30511 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HLA-FP30511 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HLA-FP30511 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HLA-FP30511 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-FP30511 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-FP30511 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-FP30511 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-FP30511 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-FP30511 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-FP30511 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-FP30511 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-FP30511 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-FP30511 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-FP30511 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-FP30511 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-FP30511 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-FP30511 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-FP30511 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-FP30511 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-FP30511 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-FP30511 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-FP30511 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-FP30511 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-FP30511 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-FP30511 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-FP30511 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-FP30511 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-FP30511 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-FP30511 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-FP30511 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-FP30511 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-FP30511 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-FP30511 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-FP30511 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-FP30511 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-FP30511 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-FP30511 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-FP30511 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-FP30511 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-FP30511 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-FP30511 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-FP30511 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-FP30511 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-FP30511 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-FP30511 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-FP30511 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-FP30511 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-FP30511 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-FP30511 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HLA-FP30511 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HLA-FP30511 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HLA-FP30511 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HLA-FP30511 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HLA-FP30511 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HLA-FP30511 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HLA-FP30511 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HLA-FP30511 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HLA-FP30511 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HLA-FP30511 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HLA-FP30511 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HLA-FP30511 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HLA-FP30511 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HLA-FP30511 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HLA-FP30511 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HLA-FP30511 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HLA-FP30511 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HLA-FP30511 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HLA-FP30511 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HLA-FP30511 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HLA-FP30511 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HLA-FP30511 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HLA-FP30511 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HLA-FP30511 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HLA-FP30511 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HLA-FP30511 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HLA-FP30511 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HLA-FP30511 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HLA-FP30511 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HLA-FP30511 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HLA-FP30511 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HLA-FP30511 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HLA-FP30511 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HLA-FP30511 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HLA-FP30511 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HLA-FP30511 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HLA-FP30511 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HLA-FP30511 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HLA-FP30511 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HLA-FP30511 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HLA-FP30511 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HLA-FP30511 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HLA-FP30511 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HLA-FP30511 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HLA-FP30511 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HLA-FP30511 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
HLA-FP30511 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HLA-FP30511 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
HLA-FP30511 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HLA-FP30511 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HLA-FP30511 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms