Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP1P29466 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP1P29466 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP1P29466 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP1P29466 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP1P29466 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP1P29466 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP1P29466 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP1P29466 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP1P29466 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP1P29466 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP1P29466 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP1P29466 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP1P29466 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP1P29466 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP1P29466 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP1P29466 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP1P29466 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP1P29466 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP1P29466 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP1P29466 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP1P29466 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP1P29466 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP1P29466 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP1P29466 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP1P29466 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP1P29466 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP1P29466 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP1P29466 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP1P29466 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP1P29466 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP1P29466 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP1P29466 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP1P29466 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP1P29466 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP1P29466 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP1P29466 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP1P29466 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP1P29466 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP1P29466 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP1P29466 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP1P29466 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP1P29466 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP1P29466 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP1P29466 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASP1P29466 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASP1P29466 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CASP1P29466 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASP1P29466 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASP1P29466 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CASP1P29466 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASP1P29466 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASP1P29466 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASP1P29466 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASP1P29466 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASP1P29466 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASP1P29466 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASP1P29466 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASP1P29466 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASP1P29466 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASP1P29466 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASP1P29466 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASP1P29466 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASP1P29466 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CASP1P29466 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASP1P29466 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CASP1P29466 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASP1P29466 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASP1P29466 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASP1P29466 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASP1P29466 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASP1P29466 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASP1P29466 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASP1P29466 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASP1P29466 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASP1P29466 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASP1P29466 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASP1P29466 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASP1P29466 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASP1P29466 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASP1P29466 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASP1P29466 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASP1P29466 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASP1P29466 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP1P29466 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP1P29466 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP1P29466 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP1P29466 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP1P29466 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP1P29466 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP1P29466 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP1P29466 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP1P29466 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP1P29466 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP1P29466 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP1P29466 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP1P29466 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP1P29466 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP1P29466 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP1P29466 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms