Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 KRT17P4-201ENST00000429445 819 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 CD59-210ENST00000528700 652 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 AP005212.2-201ENST00000584979 510 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 PSMC4-202ENST00000455878 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 AC021305.1-201ENST00000520656 1514 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 SLC50A1-202ENST00000368401 1166 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 FXYD6-FXYD2-201ENST00000532984 670 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 AC055811.3-201ENST00000584952 686 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 DGAT2L7P-201ENST00000602462 744 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 CCL18-201ENST00000616054 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 C11orf49-203ENST00000378618 1166 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 FAHD2CP-203ENST00000467292 965 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.2 ms