Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 HDAC8-204ENST00000373560 819 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 AL121983.2-202ENST00000419983 535 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 FAM27E5-201ENST00000426869 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 LINC01278-201ENST00000433061 529 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 NME6-208ENST00000435684 599 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 HMGB3-204ENST00000448905 812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 AC108474.1-201ENST00000507776 421 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 AL160191.2-201ENST00000603975 601 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 LINC01278-206ENST00000610088 554 ntTSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 AC073578.2-201ENST00000618927 464 ntTSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 BBS1-203ENST00000455748 1552 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 AF274858.1-201ENST00000406288 372 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 AC011462.4-201ENST00000616866 449 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 NIFK-AS1-203ENST00000419902 1316 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 CCL18-201ENST00000616054 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 PPHLN1-223ENST00000610488 1521 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
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PTPRBP23467 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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PTPRBP23467 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 DUT-207ENST00000559416 635 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
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PTPRBP23467 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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PTPRBP23467 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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PTPRBP23467 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 MED11-201ENST00000293777 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 AL512622.1-202ENST00000443922 478 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 ORAOV1-205ENST00000535657 709 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 AC090001.1-201ENST00000553194 467 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 STAT5A-208ENST00000587646 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 AP000357.2-201ENST00000633827 597 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 BIN3-202ENST00000399977 1340 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
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