Protein–RNA interactions for Protein: P0DO97

CCDC192, Coiled-coil domain-containing protein 192, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC192P0DO97 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms