Protein–RNA interactions for Protein: P0DMW5

SMIM10L2B, Small integral membrane protein 10-like protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM10L2BP0DMW5 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMIM10L2BP0DMW5 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMIM10L2BP0DMW5 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMIM10L2BP0DMW5 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMIM10L2BP0DMW5 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMIM10L2BP0DMW5 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMIM10L2BP0DMW5 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMIM10L2BP0DMW5 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMIM10L2BP0DMW5 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMIM10L2BP0DMW5 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMIM10L2BP0DMW5 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMIM10L2BP0DMW5 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMIM10L2BP0DMW5 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMIM10L2BP0DMW5 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMIM10L2BP0DMW5 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMIM10L2BP0DMW5 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMIM10L2BP0DMW5 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMIM10L2BP0DMW5 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMIM10L2BP0DMW5 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMIM10L2BP0DMW5 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SMIM10L2BP0DMW5 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMIM10L2BP0DMW5 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SMIM10L2BP0DMW5 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMIM10L2BP0DMW5 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMIM10L2BP0DMW5 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMIM10L2BP0DMW5 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMIM10L2BP0DMW5 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMIM10L2BP0DMW5 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMIM10L2BP0DMW5 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMIM10L2BP0DMW5 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMIM10L2BP0DMW5 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMIM10L2BP0DMW5 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMIM10L2BP0DMW5 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMIM10L2BP0DMW5 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SMIM10L2BP0DMW5 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMIM10L2BP0DMW5 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SMIM10L2BP0DMW5 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMIM10L2BP0DMW5 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMIM10L2BP0DMW5 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMIM10L2BP0DMW5 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMIM10L2BP0DMW5 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMIM10L2BP0DMW5 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMIM10L2BP0DMW5 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMIM10L2BP0DMW5 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMIM10L2BP0DMW5 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMIM10L2BP0DMW5 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMIM10L2BP0DMW5 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMIM10L2BP0DMW5 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMIM10L2BP0DMW5 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMIM10L2BP0DMW5 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMIM10L2BP0DMW5 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMIM10L2BP0DMW5 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMIM10L2BP0DMW5 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMIM10L2BP0DMW5 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMIM10L2BP0DMW5 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMIM10L2BP0DMW5 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMIM10L2BP0DMW5 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMIM10L2BP0DMW5 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMIM10L2BP0DMW5 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMIM10L2BP0DMW5 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMIM10L2BP0DMW5 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMIM10L2BP0DMW5 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMIM10L2BP0DMW5 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMIM10L2BP0DMW5 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMIM10L2BP0DMW5 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMIM10L2BP0DMW5 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMIM10L2BP0DMW5 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMIM10L2BP0DMW5 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMIM10L2BP0DMW5 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMIM10L2BP0DMW5 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMIM10L2BP0DMW5 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMIM10L2BP0DMW5 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SMIM10L2BP0DMW5 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMIM10L2BP0DMW5 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMIM10L2BP0DMW5 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMIM10L2BP0DMW5 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SMIM10L2BP0DMW5 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMIM10L2BP0DMW5 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMIM10L2BP0DMW5 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMIM10L2BP0DMW5 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMIM10L2BP0DMW5 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMIM10L2BP0DMW5 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMIM10L2BP0DMW5 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMIM10L2BP0DMW5 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMIM10L2BP0DMW5 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMIM10L2BP0DMW5 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SMIM10L2BP0DMW5 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMIM10L2BP0DMW5 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMIM10L2BP0DMW5 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMIM10L2BP0DMW5 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMIM10L2BP0DMW5 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMIM10L2BP0DMW5 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMIM10L2BP0DMW5 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMIM10L2BP0DMW5 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMIM10L2BP0DMW5 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMIM10L2BP0DMW5 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMIM10L2BP0DMW5 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMIM10L2BP0DMW5 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMIM10L2BP0DMW5 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMIM10L2BP0DMW5 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms