Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD1

RGPD2, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD2P0DJD1 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RGPD2P0DJD1 ADSL-201ENST00000216194 1620 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RGPD2P0DJD1 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RGPD2P0DJD1 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RGPD2P0DJD1 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RGPD2P0DJD1 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RGPD2P0DJD1 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RGPD2P0DJD1 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RGPD2P0DJD1 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RGPD2P0DJD1 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RGPD2P0DJD1 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RGPD2P0DJD1 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RGPD2P0DJD1 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RGPD2P0DJD1 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RGPD2P0DJD1 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RGPD2P0DJD1 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RGPD2P0DJD1 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RGPD2P0DJD1 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RGPD2P0DJD1 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
RGPD2P0DJD1 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RGPD2P0DJD1 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RGPD2P0DJD1 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RGPD2P0DJD1 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RGPD2P0DJD1 AL663074.1-201ENST00000436642 299 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RGPD2P0DJD1 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RGPD2P0DJD1 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
RGPD2P0DJD1 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RGPD2P0DJD1 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RGPD2P0DJD1 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RGPD2P0DJD1 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RGPD2P0DJD1 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RGPD2P0DJD1 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RGPD2P0DJD1 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RGPD2P0DJD1 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RGPD2P0DJD1 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RGPD2P0DJD1 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RGPD2P0DJD1 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RGPD2P0DJD1 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RGPD2P0DJD1 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RGPD2P0DJD1 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RGPD2P0DJD1 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
RGPD2P0DJD1 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
RGPD2P0DJD1 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RGPD2P0DJD1 SH3BGR-209ENST00000458295 812 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RGPD2P0DJD1 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RGPD2P0DJD1 AL132994.1-201ENST00000554098 400 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
RGPD2P0DJD1 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
RGPD2P0DJD1 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RGPD2P0DJD1 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RGPD2P0DJD1 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RGPD2P0DJD1 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RGPD2P0DJD1 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RGPD2P0DJD1 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RGPD2P0DJD1 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RGPD2P0DJD1 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RGPD2P0DJD1 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RGPD2P0DJD1 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RGPD2P0DJD1 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RGPD2P0DJD1 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RGPD2P0DJD1 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RGPD2P0DJD1 AC092265.1-201ENST00000422638 498 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RGPD2P0DJD1 AC019118.2-201ENST00000425776 718 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RGPD2P0DJD1 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RGPD2P0DJD1 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RGPD2P0DJD1 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
RGPD2P0DJD1 RN7SL396P-201ENST00000471086 295 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
RGPD2P0DJD1 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RGPD2P0DJD1 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RGPD2P0DJD1 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RGPD2P0DJD1 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RGPD2P0DJD1 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RGPD2P0DJD1 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RGPD2P0DJD1 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RGPD2P0DJD1 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RGPD2P0DJD1 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RGPD2P0DJD1 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RGPD2P0DJD1 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RGPD2P0DJD1 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RGPD2P0DJD1 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RGPD2P0DJD1 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RGPD2P0DJD1 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RGPD2P0DJD1 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RGPD2P0DJD1 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RGPD2P0DJD1 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RGPD2P0DJD1 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RGPD2P0DJD1 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RGPD2P0DJD1 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RGPD2P0DJD1 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RGPD2P0DJD1 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RGPD2P0DJD1 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RGPD2P0DJD1 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RGPD2P0DJD1 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RGPD2P0DJD1 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RGPD2P0DJD1 APOA1-203ENST00000375320 940 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RGPD2P0DJD1 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RGPD2P0DJD1 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RGPD2P0DJD1 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
RGPD2P0DJD1 PGAM1P12-201ENST00000505622 748 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
RGPD2P0DJD1 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RGPD2P0DJD1 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms