Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 TMEM25-201ENST00000313236 2409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 FEM1A-201ENST00000269856 9593 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 TTC38-201ENST00000381031 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 APBB2-211ENST00000506352 3316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 NR4A2-209ENST00000426264 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 MCC-201ENST00000302475 8257 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 CYB5D1-203ENST00000571846 1870 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 SLC4A8-205ENST00000535225 2262 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 C2-206ENST00000442278 2434 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 LHFPL2-201ENST00000380345 5043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 SEC14L3-204ENST00000403066 2474 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 MKNK1-203ENST00000371945 2618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 OR2C3-204ENST00000641802 8509 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms