Protein–RNA interactions for Protein: A8MV65

VGLL3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL3A8MV65 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 DCAF8-201ENST00000326837 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 TSPEAR-203ENST00000613245 3524 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 WFS1-202ENST00000503569 3255 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 NLGN3-205ENST00000536169 3863 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 SLC8A3-207ENST00000528359 2840 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 SLC8A3-210ENST00000534137 2837 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 SHOX-203ENST00000381578 3757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 USP5-201ENST00000229268 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 AIPL1-201ENST00000250087 2783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 SMIM27-203ENST00000451672 2382 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 BTBD3-203ENST00000399006 4826 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 LRRC8E-201ENST00000306708 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 PPP2R1B-204ENST00000426998 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 IRS4-201ENST00000372129 3928 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 NCSTN-201ENST00000294785 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 DYSF-202ENST00000394120 6543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 SHC1-203ENST00000368449 2879 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 SRPK3-208ENST00000489426 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 PRICKLE1-216ENST00000640132 4278 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 HPSE-201ENST00000311412 4615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 DGKD-202ENST00000409813 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 ATP2C2-201ENST00000262429 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 SYK-203ENST00000375751 4936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 ARAP3-203ENST00000508305 4927 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 NBEA-204ENST00000400445 11119 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 TESK2-202ENST00000372086 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 SLC4A9-201ENST00000432095 3086 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 RNF13-201ENST00000344229 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 HIRIP3-201ENST00000279392 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 LPCAT2-201ENST00000262134 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 DLX4-206ENST00000611342 1662 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 AC009533.1-201ENST00000539757 3158 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 NLRP7-206ENST00000588756 3826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 IRAK1-202ENST00000369974 3319 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 PLEKHG5-202ENST00000377725 3475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 CARS-214ENST00000529772 2637 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 VDR-208ENST00000550325 3925 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 RAB43-204ENST00000393307 4203 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 LYN-204ENST00000520220 5808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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