Protein–RNA interactions for Protein: A7E2U8

C4orf47, UPF0602 protein C4orf47, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf47A7E2U8 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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C4orf47A7E2U8 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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C4orf47A7E2U8 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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C4orf47A7E2U8 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
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C4orf47A7E2U8 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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