Protein–RNA interactions for Protein: A4D1N5

Putative uncharacterized protein FLJ40288, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4D1N5 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
A4D1N5 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
A4D1N5 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
A4D1N5 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
A4D1N5 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
A4D1N5 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
A4D1N5 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
A4D1N5 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
A4D1N5 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
A4D1N5 MSH5-202ENST00000375740 2669 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
A4D1N5 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
A4D1N5 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
A4D1N5 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
A4D1N5 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
A4D1N5 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
A4D1N5 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
A4D1N5 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
A4D1N5 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
A4D1N5 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
A4D1N5 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
A4D1N5 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC10.2□□□□□ -0.78
A4D1N5 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
A4D1N5 PIK3CG-205ENST00000496166 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
A4D1N5 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
A4D1N5 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
A4D1N5 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
A4D1N5 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
A4D1N5 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
A4D1N5 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
A4D1N5 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
A4D1N5 SLC46A1-207ENST00000612814 6376 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
A4D1N5 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
A4D1N5 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
A4D1N5 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
A4D1N5 GRIA4-201ENST00000282499 5508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
A4D1N5 CNP-202ENST00000393892 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
A4D1N5 SCOC-210ENST00000608372 5129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
A4D1N5 FAM193A-201ENST00000324666 4846 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
A4D1N5 AP001999.1-201ENST00000513405 3684 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
A4D1N5 ARHGEF4-217ENST00000611048 3486 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
A4D1N5 IFT88-202ENST00000351808 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
A4D1N5 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
A4D1N5 EPN2-205ENST00000395626 2863 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
A4D1N5 SRPRB-201ENST00000466490 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
A4D1N5 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
A4D1N5 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
A4D1N5 SGK1-220ENST00000524929 2594 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
A4D1N5 TBC1D8-AS1-201ENST00000610202 2478 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
A4D1N5 LCA5-202ENST00000392959 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
A4D1N5 UGT1A7-201ENST00000373426 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
A4D1N5 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
A4D1N5 DHX38-201ENST00000268482 4608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
A4D1N5 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
A4D1N5 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
A4D1N5 LIX1L-201ENST00000604000 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
A4D1N5 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
A4D1N5 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
A4D1N5 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
A4D1N5 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
A4D1N5 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
A4D1N5 PPP1R15B-201ENST00000367188 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
A4D1N5 CACNA1G-229ENST00000514181 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
A4D1N5 AP002761.4-201ENST00000565433 3361 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
A4D1N5 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
A4D1N5 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
A4D1N5 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
A4D1N5 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
A4D1N5 PFKM-202ENST00000340802 3176 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
A4D1N5 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
A4D1N5 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
A4D1N5 PER3-209ENST00000614998 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
A4D1N5 CCDC88C-201ENST00000331194 3104 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
A4D1N5 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
A4D1N5 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
A4D1N5 ILF3-201ENST00000250241 3035 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
A4D1N5 KDM6A-214ENST00000621147 2876 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
A4D1N5 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
A4D1N5 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
A4D1N5 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
A4D1N5 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
A4D1N5 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
A4D1N5 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
A4D1N5 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
A4D1N5 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC10.19□□□□□ -0.78
A4D1N5 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
A4D1N5 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
A4D1N5 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
A4D1N5 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
A4D1N5 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
A4D1N5 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
A4D1N5 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
A4D1N5 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC10.19□□□□□ -0.78
A4D1N5 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
A4D1N5 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
A4D1N5 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
A4D1N5 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
A4D1N5 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
A4D1N5 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
A4D1N5 PAX8-204ENST00000397647 3633 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
A4D1N5 RRBP1-201ENST00000246043 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms