Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVW-1Q9UQF0 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVW-1Q9UQF0 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVW-1Q9UQF0 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVW-1Q9UQF0 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVW-1Q9UQF0 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVW-1Q9UQF0 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVW-1Q9UQF0 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVW-1Q9UQF0 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVW-1Q9UQF0 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVW-1Q9UQF0 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVW-1Q9UQF0 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVW-1Q9UQF0 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVW-1Q9UQF0 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVW-1Q9UQF0 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVW-1Q9UQF0 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVW-1Q9UQF0 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVW-1Q9UQF0 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVW-1Q9UQF0 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVW-1Q9UQF0 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVW-1Q9UQF0 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVW-1Q9UQF0 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVW-1Q9UQF0 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVW-1Q9UQF0 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVW-1Q9UQF0 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVW-1Q9UQF0 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVW-1Q9UQF0 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVW-1Q9UQF0 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVW-1Q9UQF0 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVW-1Q9UQF0 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVW-1Q9UQF0 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVW-1Q9UQF0 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVW-1Q9UQF0 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVW-1Q9UQF0 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVW-1Q9UQF0 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVW-1Q9UQF0 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVW-1Q9UQF0 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVW-1Q9UQF0 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVW-1Q9UQF0 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVW-1Q9UQF0 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVW-1Q9UQF0 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVW-1Q9UQF0 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVW-1Q9UQF0 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVW-1Q9UQF0 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVW-1Q9UQF0 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVW-1Q9UQF0 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVW-1Q9UQF0 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVW-1Q9UQF0 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVW-1Q9UQF0 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVW-1Q9UQF0 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVW-1Q9UQF0 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVW-1Q9UQF0 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVW-1Q9UQF0 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVW-1Q9UQF0 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVW-1Q9UQF0 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVW-1Q9UQF0 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVW-1Q9UQF0 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVW-1Q9UQF0 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVW-1Q9UQF0 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVW-1Q9UQF0 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVW-1Q9UQF0 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVW-1Q9UQF0 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVW-1Q9UQF0 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVW-1Q9UQF0 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVW-1Q9UQF0 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVW-1Q9UQF0 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVW-1Q9UQF0 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVW-1Q9UQF0 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVW-1Q9UQF0 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVW-1Q9UQF0 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVW-1Q9UQF0 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVW-1Q9UQF0 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVW-1Q9UQF0 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVW-1Q9UQF0 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVW-1Q9UQF0 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVW-1Q9UQF0 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVW-1Q9UQF0 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVW-1Q9UQF0 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVW-1Q9UQF0 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVW-1Q9UQF0 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVW-1Q9UQF0 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVW-1Q9UQF0 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVW-1Q9UQF0 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVW-1Q9UQF0 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVW-1Q9UQF0 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVW-1Q9UQF0 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVW-1Q9UQF0 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVW-1Q9UQF0 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVW-1Q9UQF0 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVW-1Q9UQF0 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVW-1Q9UQF0 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVW-1Q9UQF0 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVW-1Q9UQF0 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVW-1Q9UQF0 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVW-1Q9UQF0 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVW-1Q9UQF0 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVW-1Q9UQF0 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVW-1Q9UQF0 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVW-1Q9UQF0 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVW-1Q9UQF0 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms