Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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