Protein–RNA interactions for Protein: Q9P232

CNTN3, Contactin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN3Q9P232 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms