Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC7

CYLD, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase CYLD, humanhuman

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYLDQ9NQC7 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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