Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP72

RAB18, Ras-related protein Rab-18, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB18Q9NP72 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RAB18Q9NP72 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
RAB18Q9NP72 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RAB18Q9NP72 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RAB18Q9NP72 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RAB18Q9NP72 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RAB18Q9NP72 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
RAB18Q9NP72 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
RAB18Q9NP72 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
RAB18Q9NP72 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
RAB18Q9NP72 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
RAB18Q9NP72 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
RAB18Q9NP72 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
RAB18Q9NP72 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
RAB18Q9NP72 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
RAB18Q9NP72 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
RAB18Q9NP72 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
RAB18Q9NP72 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RAB18Q9NP72 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RAB18Q9NP72 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
RAB18Q9NP72 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
RAB18Q9NP72 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RAB18Q9NP72 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
RAB18Q9NP72 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RAB18Q9NP72 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
RAB18Q9NP72 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RAB18Q9NP72 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
RAB18Q9NP72 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
RAB18Q9NP72 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
RAB18Q9NP72 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
RAB18Q9NP72 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RAB18Q9NP72 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RAB18Q9NP72 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
RAB18Q9NP72 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RAB18Q9NP72 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RAB18Q9NP72 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RAB18Q9NP72 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
RAB18Q9NP72 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RAB18Q9NP72 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
RAB18Q9NP72 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RAB18Q9NP72 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RAB18Q9NP72 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
RAB18Q9NP72 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RAB18Q9NP72 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RAB18Q9NP72 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RAB18Q9NP72 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RAB18Q9NP72 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RAB18Q9NP72 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
RAB18Q9NP72 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RAB18Q9NP72 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
RAB18Q9NP72 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RAB18Q9NP72 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RAB18Q9NP72 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
RAB18Q9NP72 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
RAB18Q9NP72 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
RAB18Q9NP72 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RAB18Q9NP72 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
RAB18Q9NP72 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RAB18Q9NP72 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RAB18Q9NP72 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RAB18Q9NP72 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RAB18Q9NP72 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
RAB18Q9NP72 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RAB18Q9NP72 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RAB18Q9NP72 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
RAB18Q9NP72 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RAB18Q9NP72 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
RAB18Q9NP72 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
RAB18Q9NP72 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
RAB18Q9NP72 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
RAB18Q9NP72 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RAB18Q9NP72 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RAB18Q9NP72 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
RAB18Q9NP72 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
RAB18Q9NP72 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
RAB18Q9NP72 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RAB18Q9NP72 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
RAB18Q9NP72 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RAB18Q9NP72 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RAB18Q9NP72 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RAB18Q9NP72 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
RAB18Q9NP72 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RAB18Q9NP72 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RAB18Q9NP72 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RAB18Q9NP72 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RAB18Q9NP72 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
RAB18Q9NP72 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RAB18Q9NP72 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RAB18Q9NP72 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
RAB18Q9NP72 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
RAB18Q9NP72 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
RAB18Q9NP72 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
RAB18Q9NP72 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
RAB18Q9NP72 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
RAB18Q9NP72 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
RAB18Q9NP72 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
RAB18Q9NP72 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
RAB18Q9NP72 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
RAB18Q9NP72 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
RAB18Q9NP72 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms