Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY60

GABARAPL3, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL3Q9BY60 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
GABARAPL3Q9BY60 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GABARAPL3Q9BY60 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
GABARAPL3Q9BY60 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
GABARAPL3Q9BY60 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
GABARAPL3Q9BY60 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
GABARAPL3Q9BY60 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
GABARAPL3Q9BY60 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GABARAPL3Q9BY60 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GABARAPL3Q9BY60 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
GABARAPL3Q9BY60 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
GABARAPL3Q9BY60 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GABARAPL3Q9BY60 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GABARAPL3Q9BY60 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GABARAPL3Q9BY60 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
GABARAPL3Q9BY60 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
GABARAPL3Q9BY60 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GABARAPL3Q9BY60 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GABARAPL3Q9BY60 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
GABARAPL3Q9BY60 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GABARAPL3Q9BY60 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
GABARAPL3Q9BY60 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GABARAPL3Q9BY60 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GABARAPL3Q9BY60 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GABARAPL3Q9BY60 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
GABARAPL3Q9BY60 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
GABARAPL3Q9BY60 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
GABARAPL3Q9BY60 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
GABARAPL3Q9BY60 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GABARAPL3Q9BY60 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GABARAPL3Q9BY60 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GABARAPL3Q9BY60 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GABARAPL3Q9BY60 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GABARAPL3Q9BY60 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GABARAPL3Q9BY60 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GABARAPL3Q9BY60 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GABARAPL3Q9BY60 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GABARAPL3Q9BY60 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GABARAPL3Q9BY60 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GABARAPL3Q9BY60 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GABARAPL3Q9BY60 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
GABARAPL3Q9BY60 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GABARAPL3Q9BY60 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GABARAPL3Q9BY60 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GABARAPL3Q9BY60 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GABARAPL3Q9BY60 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GABARAPL3Q9BY60 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GABARAPL3Q9BY60 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GABARAPL3Q9BY60 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GABARAPL3Q9BY60 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GABARAPL3Q9BY60 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GABARAPL3Q9BY60 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GABARAPL3Q9BY60 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GABARAPL3Q9BY60 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GABARAPL3Q9BY60 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GABARAPL3Q9BY60 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GABARAPL3Q9BY60 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GABARAPL3Q9BY60 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GABARAPL3Q9BY60 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GABARAPL3Q9BY60 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GABARAPL3Q9BY60 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GABARAPL3Q9BY60 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GABARAPL3Q9BY60 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
GABARAPL3Q9BY60 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GABARAPL3Q9BY60 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GABARAPL3Q9BY60 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GABARAPL3Q9BY60 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GABARAPL3Q9BY60 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GABARAPL3Q9BY60 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GABARAPL3Q9BY60 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GABARAPL3Q9BY60 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GABARAPL3Q9BY60 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GABARAPL3Q9BY60 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GABARAPL3Q9BY60 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
GABARAPL3Q9BY60 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
GABARAPL3Q9BY60 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GABARAPL3Q9BY60 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GABARAPL3Q9BY60 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GABARAPL3Q9BY60 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GABARAPL3Q9BY60 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GABARAPL3Q9BY60 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GABARAPL3Q9BY60 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GABARAPL3Q9BY60 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GABARAPL3Q9BY60 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GABARAPL3Q9BY60 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GABARAPL3Q9BY60 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GABARAPL3Q9BY60 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GABARAPL3Q9BY60 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GABARAPL3Q9BY60 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GABARAPL3Q9BY60 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GABARAPL3Q9BY60 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GABARAPL3Q9BY60 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GABARAPL3Q9BY60 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GABARAPL3Q9BY60 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
GABARAPL3Q9BY60 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
GABARAPL3Q9BY60 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
GABARAPL3Q9BY60 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GABARAPL3Q9BY60 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
GABARAPL3Q9BY60 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GABARAPL3Q9BY60 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms