Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXC9

BBS2, Bardet-Biedl syndrome 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS2Q9BXC9 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BBS2Q9BXC9 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BBS2Q9BXC9 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BBS2Q9BXC9 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BBS2Q9BXC9 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BBS2Q9BXC9 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BBS2Q9BXC9 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
BBS2Q9BXC9 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BBS2Q9BXC9 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BBS2Q9BXC9 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BBS2Q9BXC9 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BBS2Q9BXC9 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BBS2Q9BXC9 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BBS2Q9BXC9 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BBS2Q9BXC9 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BBS2Q9BXC9 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BBS2Q9BXC9 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BBS2Q9BXC9 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BBS2Q9BXC9 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BBS2Q9BXC9 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BBS2Q9BXC9 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
BBS2Q9BXC9 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
BBS2Q9BXC9 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BBS2Q9BXC9 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BBS2Q9BXC9 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
BBS2Q9BXC9 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
BBS2Q9BXC9 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
BBS2Q9BXC9 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BBS2Q9BXC9 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BBS2Q9BXC9 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BBS2Q9BXC9 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
BBS2Q9BXC9 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BBS2Q9BXC9 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BBS2Q9BXC9 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BBS2Q9BXC9 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BBS2Q9BXC9 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BBS2Q9BXC9 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BBS2Q9BXC9 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BBS2Q9BXC9 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BBS2Q9BXC9 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BBS2Q9BXC9 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BBS2Q9BXC9 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BBS2Q9BXC9 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BBS2Q9BXC9 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BBS2Q9BXC9 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BBS2Q9BXC9 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BBS2Q9BXC9 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BBS2Q9BXC9 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BBS2Q9BXC9 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BBS2Q9BXC9 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BBS2Q9BXC9 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BBS2Q9BXC9 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BBS2Q9BXC9 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BBS2Q9BXC9 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BBS2Q9BXC9 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BBS2Q9BXC9 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BBS2Q9BXC9 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BBS2Q9BXC9 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BBS2Q9BXC9 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BBS2Q9BXC9 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BBS2Q9BXC9 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BBS2Q9BXC9 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BBS2Q9BXC9 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BBS2Q9BXC9 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BBS2Q9BXC9 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BBS2Q9BXC9 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
BBS2Q9BXC9 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BBS2Q9BXC9 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BBS2Q9BXC9 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BBS2Q9BXC9 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BBS2Q9BXC9 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BBS2Q9BXC9 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BBS2Q9BXC9 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BBS2Q9BXC9 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BBS2Q9BXC9 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BBS2Q9BXC9 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BBS2Q9BXC9 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BBS2Q9BXC9 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BBS2Q9BXC9 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BBS2Q9BXC9 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BBS2Q9BXC9 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BBS2Q9BXC9 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BBS2Q9BXC9 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BBS2Q9BXC9 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BBS2Q9BXC9 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BBS2Q9BXC9 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BBS2Q9BXC9 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BBS2Q9BXC9 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BBS2Q9BXC9 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BBS2Q9BXC9 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BBS2Q9BXC9 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
BBS2Q9BXC9 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BBS2Q9BXC9 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BBS2Q9BXC9 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BBS2Q9BXC9 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BBS2Q9BXC9 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
BBS2Q9BXC9 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BBS2Q9BXC9 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BBS2Q9BXC9 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BBS2Q9BXC9 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms