Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MCMBPQ9BTE3 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MCMBPQ9BTE3 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MCMBPQ9BTE3 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
MCMBPQ9BTE3 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MCMBPQ9BTE3 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MCMBPQ9BTE3 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MCMBPQ9BTE3 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MCMBPQ9BTE3 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MCMBPQ9BTE3 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
MCMBPQ9BTE3 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MCMBPQ9BTE3 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
MCMBPQ9BTE3 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
MCMBPQ9BTE3 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MCMBPQ9BTE3 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
MCMBPQ9BTE3 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MCMBPQ9BTE3 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MCMBPQ9BTE3 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MCMBPQ9BTE3 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MCMBPQ9BTE3 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MCMBPQ9BTE3 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MCMBPQ9BTE3 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MCMBPQ9BTE3 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MCMBPQ9BTE3 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MCMBPQ9BTE3 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MCMBPQ9BTE3 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MCMBPQ9BTE3 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MCMBPQ9BTE3 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MCMBPQ9BTE3 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MCMBPQ9BTE3 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MCMBPQ9BTE3 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MCMBPQ9BTE3 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MCMBPQ9BTE3 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MCMBPQ9BTE3 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MCMBPQ9BTE3 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MCMBPQ9BTE3 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MCMBPQ9BTE3 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MCMBPQ9BTE3 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MCMBPQ9BTE3 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MCMBPQ9BTE3 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MCMBPQ9BTE3 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
MCMBPQ9BTE3 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MCMBPQ9BTE3 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MCMBPQ9BTE3 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MCMBPQ9BTE3 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
MCMBPQ9BTE3 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
MCMBPQ9BTE3 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MCMBPQ9BTE3 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MCMBPQ9BTE3 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MCMBPQ9BTE3 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MCMBPQ9BTE3 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MCMBPQ9BTE3 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
MCMBPQ9BTE3 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MCMBPQ9BTE3 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MCMBPQ9BTE3 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
MCMBPQ9BTE3 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MCMBPQ9BTE3 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MCMBPQ9BTE3 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MCMBPQ9BTE3 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MCMBPQ9BTE3 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MCMBPQ9BTE3 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MCMBPQ9BTE3 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MCMBPQ9BTE3 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MCMBPQ9BTE3 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MCMBPQ9BTE3 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MCMBPQ9BTE3 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MCMBPQ9BTE3 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MCMBPQ9BTE3 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
MCMBPQ9BTE3 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
MCMBPQ9BTE3 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MCMBPQ9BTE3 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MCMBPQ9BTE3 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MCMBPQ9BTE3 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MCMBPQ9BTE3 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MCMBPQ9BTE3 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MCMBPQ9BTE3 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MCMBPQ9BTE3 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MCMBPQ9BTE3 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MCMBPQ9BTE3 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MCMBPQ9BTE3 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MCMBPQ9BTE3 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MCMBPQ9BTE3 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MCMBPQ9BTE3 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MCMBPQ9BTE3 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MCMBPQ9BTE3 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MCMBPQ9BTE3 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
MCMBPQ9BTE3 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MCMBPQ9BTE3 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MCMBPQ9BTE3 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MCMBPQ9BTE3 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MCMBPQ9BTE3 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MCMBPQ9BTE3 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MCMBPQ9BTE3 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MCMBPQ9BTE3 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MCMBPQ9BTE3 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
MCMBPQ9BTE3 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MCMBPQ9BTE3 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MCMBPQ9BTE3 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MCMBPQ9BTE3 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
MCMBPQ9BTE3 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms