Protein–RNA interactions for Protein: Q96S96

PEBP4, Phosphatidylethanolamine-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEBP4Q96S96 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PEBP4Q96S96 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PEBP4Q96S96 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PEBP4Q96S96 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PEBP4Q96S96 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PEBP4Q96S96 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PEBP4Q96S96 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PEBP4Q96S96 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PEBP4Q96S96 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PEBP4Q96S96 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PEBP4Q96S96 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PEBP4Q96S96 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PEBP4Q96S96 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PEBP4Q96S96 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PEBP4Q96S96 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PEBP4Q96S96 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PEBP4Q96S96 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PEBP4Q96S96 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PEBP4Q96S96 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PEBP4Q96S96 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PEBP4Q96S96 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PEBP4Q96S96 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PEBP4Q96S96 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PEBP4Q96S96 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PEBP4Q96S96 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PEBP4Q96S96 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PEBP4Q96S96 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PEBP4Q96S96 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PEBP4Q96S96 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PEBP4Q96S96 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PEBP4Q96S96 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PEBP4Q96S96 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PEBP4Q96S96 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PEBP4Q96S96 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PEBP4Q96S96 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PEBP4Q96S96 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PEBP4Q96S96 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PEBP4Q96S96 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PEBP4Q96S96 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PEBP4Q96S96 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PEBP4Q96S96 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PEBP4Q96S96 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PEBP4Q96S96 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PEBP4Q96S96 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PEBP4Q96S96 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PEBP4Q96S96 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PEBP4Q96S96 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PEBP4Q96S96 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PEBP4Q96S96 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PEBP4Q96S96 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PEBP4Q96S96 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PEBP4Q96S96 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PEBP4Q96S96 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PEBP4Q96S96 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PEBP4Q96S96 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PEBP4Q96S96 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PEBP4Q96S96 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PEBP4Q96S96 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PEBP4Q96S96 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PEBP4Q96S96 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PEBP4Q96S96 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PEBP4Q96S96 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PEBP4Q96S96 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PEBP4Q96S96 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PEBP4Q96S96 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PEBP4Q96S96 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PEBP4Q96S96 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PEBP4Q96S96 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PEBP4Q96S96 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PEBP4Q96S96 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PEBP4Q96S96 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PEBP4Q96S96 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PEBP4Q96S96 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PEBP4Q96S96 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PEBP4Q96S96 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PEBP4Q96S96 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PEBP4Q96S96 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PEBP4Q96S96 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PEBP4Q96S96 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PEBP4Q96S96 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PEBP4Q96S96 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PEBP4Q96S96 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PEBP4Q96S96 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PEBP4Q96S96 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PEBP4Q96S96 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PEBP4Q96S96 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PEBP4Q96S96 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PEBP4Q96S96 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PEBP4Q96S96 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PEBP4Q96S96 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PEBP4Q96S96 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PEBP4Q96S96 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PEBP4Q96S96 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PEBP4Q96S96 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PEBP4Q96S96 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PEBP4Q96S96 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PEBP4Q96S96 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PEBP4Q96S96 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PEBP4Q96S96 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PEBP4Q96S96 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.2 ms