Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ19

KCTD13, BTB/POZ domain-containing adapter for CUL3-mediated RhoA degradation protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD13Q8WZ19 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCTD13Q8WZ19 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCTD13Q8WZ19 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCTD13Q8WZ19 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCTD13Q8WZ19 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCTD13Q8WZ19 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCTD13Q8WZ19 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
KCTD13Q8WZ19 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCTD13Q8WZ19 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCTD13Q8WZ19 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCTD13Q8WZ19 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
KCTD13Q8WZ19 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCTD13Q8WZ19 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCTD13Q8WZ19 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCTD13Q8WZ19 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCTD13Q8WZ19 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCTD13Q8WZ19 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCTD13Q8WZ19 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCTD13Q8WZ19 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCTD13Q8WZ19 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCTD13Q8WZ19 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCTD13Q8WZ19 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCTD13Q8WZ19 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCTD13Q8WZ19 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCTD13Q8WZ19 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCTD13Q8WZ19 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCTD13Q8WZ19 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCTD13Q8WZ19 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCTD13Q8WZ19 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCTD13Q8WZ19 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCTD13Q8WZ19 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCTD13Q8WZ19 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCTD13Q8WZ19 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCTD13Q8WZ19 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
KCTD13Q8WZ19 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCTD13Q8WZ19 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCTD13Q8WZ19 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCTD13Q8WZ19 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCTD13Q8WZ19 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCTD13Q8WZ19 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCTD13Q8WZ19 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCTD13Q8WZ19 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCTD13Q8WZ19 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCTD13Q8WZ19 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCTD13Q8WZ19 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCTD13Q8WZ19 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCTD13Q8WZ19 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
KCTD13Q8WZ19 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCTD13Q8WZ19 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCTD13Q8WZ19 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCTD13Q8WZ19 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCTD13Q8WZ19 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCTD13Q8WZ19 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
KCTD13Q8WZ19 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
KCTD13Q8WZ19 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
KCTD13Q8WZ19 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCTD13Q8WZ19 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCTD13Q8WZ19 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCTD13Q8WZ19 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCTD13Q8WZ19 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCTD13Q8WZ19 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCTD13Q8WZ19 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCTD13Q8WZ19 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCTD13Q8WZ19 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCTD13Q8WZ19 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCTD13Q8WZ19 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCTD13Q8WZ19 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCTD13Q8WZ19 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCTD13Q8WZ19 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCTD13Q8WZ19 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCTD13Q8WZ19 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCTD13Q8WZ19 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
KCTD13Q8WZ19 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCTD13Q8WZ19 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCTD13Q8WZ19 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCTD13Q8WZ19 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCTD13Q8WZ19 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCTD13Q8WZ19 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCTD13Q8WZ19 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCTD13Q8WZ19 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCTD13Q8WZ19 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCTD13Q8WZ19 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCTD13Q8WZ19 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCTD13Q8WZ19 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCTD13Q8WZ19 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCTD13Q8WZ19 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
KCTD13Q8WZ19 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCTD13Q8WZ19 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
KCTD13Q8WZ19 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCTD13Q8WZ19 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
KCTD13Q8WZ19 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
KCTD13Q8WZ19 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCTD13Q8WZ19 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCTD13Q8WZ19 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCTD13Q8WZ19 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCTD13Q8WZ19 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCTD13Q8WZ19 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCTD13Q8WZ19 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCTD13Q8WZ19 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCTD13Q8WZ19 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms