Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.4 ms