Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W8

FAM71D, Protein FAM71D, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71DQ8N9W8 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM71DQ8N9W8 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM71DQ8N9W8 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM71DQ8N9W8 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM71DQ8N9W8 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM71DQ8N9W8 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM71DQ8N9W8 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM71DQ8N9W8 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM71DQ8N9W8 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM71DQ8N9W8 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM71DQ8N9W8 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM71DQ8N9W8 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM71DQ8N9W8 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM71DQ8N9W8 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM71DQ8N9W8 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM71DQ8N9W8 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM71DQ8N9W8 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM71DQ8N9W8 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM71DQ8N9W8 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM71DQ8N9W8 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM71DQ8N9W8 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM71DQ8N9W8 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM71DQ8N9W8 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM71DQ8N9W8 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM71DQ8N9W8 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM71DQ8N9W8 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM71DQ8N9W8 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM71DQ8N9W8 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM71DQ8N9W8 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM71DQ8N9W8 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM71DQ8N9W8 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM71DQ8N9W8 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM71DQ8N9W8 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM71DQ8N9W8 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM71DQ8N9W8 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM71DQ8N9W8 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM71DQ8N9W8 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM71DQ8N9W8 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM71DQ8N9W8 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM71DQ8N9W8 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM71DQ8N9W8 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM71DQ8N9W8 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM71DQ8N9W8 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM71DQ8N9W8 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM71DQ8N9W8 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM71DQ8N9W8 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM71DQ8N9W8 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM71DQ8N9W8 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM71DQ8N9W8 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM71DQ8N9W8 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM71DQ8N9W8 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM71DQ8N9W8 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM71DQ8N9W8 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM71DQ8N9W8 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM71DQ8N9W8 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM71DQ8N9W8 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM71DQ8N9W8 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM71DQ8N9W8 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM71DQ8N9W8 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM71DQ8N9W8 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM71DQ8N9W8 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM71DQ8N9W8 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM71DQ8N9W8 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM71DQ8N9W8 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM71DQ8N9W8 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM71DQ8N9W8 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM71DQ8N9W8 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM71DQ8N9W8 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM71DQ8N9W8 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM71DQ8N9W8 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM71DQ8N9W8 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM71DQ8N9W8 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM71DQ8N9W8 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM71DQ8N9W8 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM71DQ8N9W8 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM71DQ8N9W8 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM71DQ8N9W8 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM71DQ8N9W8 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM71DQ8N9W8 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM71DQ8N9W8 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM71DQ8N9W8 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM71DQ8N9W8 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM71DQ8N9W8 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM71DQ8N9W8 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
FAM71DQ8N9W8 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
FAM71DQ8N9W8 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
FAM71DQ8N9W8 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
FAM71DQ8N9W8 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
FAM71DQ8N9W8 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
FAM71DQ8N9W8 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM71DQ8N9W8 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM71DQ8N9W8 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM71DQ8N9W8 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM71DQ8N9W8 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM71DQ8N9W8 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM71DQ8N9W8 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM71DQ8N9W8 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM71DQ8N9W8 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM71DQ8N9W8 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM71DQ8N9W8 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.7 ms