Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F7

GCSAM, Germinal center-associated signaling and motility protein, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSAMQ8N6F7 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC12.66□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms