Protein–RNA interactions for Protein: Q8N488

RYBP, RING1 and YY1-binding protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYBPQ8N488 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms