Protein–RNA interactions for Protein: Q8N448

LNX2, Ligand of Numb protein X 2, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNX2Q8N448 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LNX2Q8N448 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LNX2Q8N448 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LNX2Q8N448 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LNX2Q8N448 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LNX2Q8N448 ADCYAP1R1-207ENST00000614107 6575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LNX2Q8N448 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LNX2Q8N448 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LNX2Q8N448 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LNX2Q8N448 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LNX2Q8N448 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LNX2Q8N448 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LNX2Q8N448 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LNX2Q8N448 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
LNX2Q8N448 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LNX2Q8N448 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LNX2Q8N448 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LNX2Q8N448 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LNX2Q8N448 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LNX2Q8N448 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
LNX2Q8N448 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LNX2Q8N448 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LNX2Q8N448 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LNX2Q8N448 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LNX2Q8N448 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LNX2Q8N448 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LNX2Q8N448 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LNX2Q8N448 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
LNX2Q8N448 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
LNX2Q8N448 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LNX2Q8N448 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LNX2Q8N448 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LNX2Q8N448 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LNX2Q8N448 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LNX2Q8N448 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LNX2Q8N448 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LNX2Q8N448 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LNX2Q8N448 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LNX2Q8N448 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LNX2Q8N448 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LNX2Q8N448 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
LNX2Q8N448 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LNX2Q8N448 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LNX2Q8N448 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LNX2Q8N448 ELK1-201ENST00000247161 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LNX2Q8N448 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LNX2Q8N448 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LNX2Q8N448 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LNX2Q8N448 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LNX2Q8N448 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LNX2Q8N448 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LNX2Q8N448 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LNX2Q8N448 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LNX2Q8N448 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LNX2Q8N448 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LNX2Q8N448 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LNX2Q8N448 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LNX2Q8N448 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LNX2Q8N448 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LNX2Q8N448 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LNX2Q8N448 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
LNX2Q8N448 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LNX2Q8N448 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LNX2Q8N448 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
LNX2Q8N448 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LNX2Q8N448 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LNX2Q8N448 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LNX2Q8N448 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LNX2Q8N448 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LNX2Q8N448 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LNX2Q8N448 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LNX2Q8N448 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LNX2Q8N448 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LNX2Q8N448 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LNX2Q8N448 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LNX2Q8N448 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LNX2Q8N448 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LNX2Q8N448 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LNX2Q8N448 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LNX2Q8N448 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LNX2Q8N448 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LNX2Q8N448 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LNX2Q8N448 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LNX2Q8N448 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LNX2Q8N448 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LNX2Q8N448 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LNX2Q8N448 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LNX2Q8N448 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LNX2Q8N448 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LNX2Q8N448 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
LNX2Q8N448 INO80-202ENST00000401393 5991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LNX2Q8N448 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LNX2Q8N448 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LNX2Q8N448 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LNX2Q8N448 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LNX2Q8N448 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LNX2Q8N448 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LNX2Q8N448 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LNX2Q8N448 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LNX2Q8N448 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms