Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 NOX5-201ENST00000260364 8592 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 EMC10-201ENST00000334976 9446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69 ms