Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWD4

CCDC117, Coiled-coil domain-containing protein 117, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC117Q8IWD4 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 PDGFRB-201ENST00000261799 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 PTPRS-204ENST00000587303 6353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 CEP68-202ENST00000377990 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms