Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVW4

CDKL3, Cyclin-dependent kinase-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL3Q8IVW4 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms