Protein–RNA interactions for Protein: Q6XPS3

TPTE2, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate 3-phosphatase TPTE2, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPTE2Q6XPS3 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms