Protein–RNA interactions for Protein: Q68J44

DUPD1, Dual specificity phosphatase DUPD1, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUPD1Q68J44 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.5 ms