Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSJ5

HP1BP3, Heterochromatin protein 1-binding protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HP1BP3Q5SSJ5 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HP1BP3Q5SSJ5 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HP1BP3Q5SSJ5 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HP1BP3Q5SSJ5 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HP1BP3Q5SSJ5 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HP1BP3Q5SSJ5 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HP1BP3Q5SSJ5 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HP1BP3Q5SSJ5 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HP1BP3Q5SSJ5 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HP1BP3Q5SSJ5 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HP1BP3Q5SSJ5 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HP1BP3Q5SSJ5 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HP1BP3Q5SSJ5 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HP1BP3Q5SSJ5 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HP1BP3Q5SSJ5 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HP1BP3Q5SSJ5 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HP1BP3Q5SSJ5 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HP1BP3Q5SSJ5 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HP1BP3Q5SSJ5 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HP1BP3Q5SSJ5 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HP1BP3Q5SSJ5 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HP1BP3Q5SSJ5 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HP1BP3Q5SSJ5 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HP1BP3Q5SSJ5 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HP1BP3Q5SSJ5 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HP1BP3Q5SSJ5 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HP1BP3Q5SSJ5 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HP1BP3Q5SSJ5 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HP1BP3Q5SSJ5 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HP1BP3Q5SSJ5 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HP1BP3Q5SSJ5 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HP1BP3Q5SSJ5 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HP1BP3Q5SSJ5 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HP1BP3Q5SSJ5 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HP1BP3Q5SSJ5 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HP1BP3Q5SSJ5 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HP1BP3Q5SSJ5 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HP1BP3Q5SSJ5 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HP1BP3Q5SSJ5 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HP1BP3Q5SSJ5 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HP1BP3Q5SSJ5 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HP1BP3Q5SSJ5 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HP1BP3Q5SSJ5 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HP1BP3Q5SSJ5 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HP1BP3Q5SSJ5 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HP1BP3Q5SSJ5 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HP1BP3Q5SSJ5 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HP1BP3Q5SSJ5 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HP1BP3Q5SSJ5 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HP1BP3Q5SSJ5 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HP1BP3Q5SSJ5 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HP1BP3Q5SSJ5 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HP1BP3Q5SSJ5 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HP1BP3Q5SSJ5 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HP1BP3Q5SSJ5 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HP1BP3Q5SSJ5 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HP1BP3Q5SSJ5 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HP1BP3Q5SSJ5 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HP1BP3Q5SSJ5 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HP1BP3Q5SSJ5 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HP1BP3Q5SSJ5 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HP1BP3Q5SSJ5 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HP1BP3Q5SSJ5 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HP1BP3Q5SSJ5 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HP1BP3Q5SSJ5 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HP1BP3Q5SSJ5 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HP1BP3Q5SSJ5 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HP1BP3Q5SSJ5 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HP1BP3Q5SSJ5 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HP1BP3Q5SSJ5 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HP1BP3Q5SSJ5 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HP1BP3Q5SSJ5 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HP1BP3Q5SSJ5 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HP1BP3Q5SSJ5 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HP1BP3Q5SSJ5 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HP1BP3Q5SSJ5 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HP1BP3Q5SSJ5 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HP1BP3Q5SSJ5 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HP1BP3Q5SSJ5 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HP1BP3Q5SSJ5 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HP1BP3Q5SSJ5 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HP1BP3Q5SSJ5 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HP1BP3Q5SSJ5 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HP1BP3Q5SSJ5 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HP1BP3Q5SSJ5 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HP1BP3Q5SSJ5 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HP1BP3Q5SSJ5 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HP1BP3Q5SSJ5 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HP1BP3Q5SSJ5 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HP1BP3Q5SSJ5 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HP1BP3Q5SSJ5 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HP1BP3Q5SSJ5 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HP1BP3Q5SSJ5 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HP1BP3Q5SSJ5 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HP1BP3Q5SSJ5 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HP1BP3Q5SSJ5 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HP1BP3Q5SSJ5 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HP1BP3Q5SSJ5 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HP1BP3Q5SSJ5 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HP1BP3Q5SSJ5 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms