Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 COLQ-201ENST00000383781 2784 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 GRIN1-202ENST00000371546 4114 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 AC092802.1-201ENST00000421762 2447 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 RAPGEF1-201ENST00000372189 6085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 ALOX15B-202ENST00000380183 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 AC090572.2-201ENST00000520649 761 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC10.85□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 AP002761.4-201ENST00000565433 3361 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 RRM2B-211ENST00000621845 3483 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 KRI1-201ENST00000312962 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 DNAI2-202ENST00000446837 2474 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 TRIM3-203ENST00000525074 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 MKL1-211ENST00000618196 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 AC022497.1-201ENST00000624916 3691 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 CHGB-201ENST00000378961 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 WDR60-202ENST00000407559 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 MID1IP1-204ENST00000614558 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 HNRNPH1-216ENST00000510411 2105 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 MCPH1-AS1-201ENST00000515608 2147 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 UBFD1-207ENST00000567212 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 CRY2-202ENST00000443527 4203 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 SEC14L1-212ENST00000585618 2712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 KLK10-203ENST00000391805 3006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 CDK5RAP1-203ENST00000357886 2164 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 KDM8-201ENST00000286096 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 TBX3-202ENST00000349155 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 GOLGA6D-201ENST00000434739 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 AGAP5-202ENST00000443782 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 ARHGAP45-210ENST00000590214 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 BAIAP3-201ENST00000324385 4678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 RSPO2-201ENST00000276659 3111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 HOTTIP-203ENST00000521028 3345 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 SZRD1-201ENST00000401088 3636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 PPP1R42-212ENST00000522909 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 AP2M1-207ENST00000439647 1950 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 SLC25A18-202ENST00000399813 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 ACSL1-210ENST00000513317 2469 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 MEF2D-202ENST00000360595 3194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74 ms