Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CTXN3Q4LDR2 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CTXN3Q4LDR2 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CTXN3Q4LDR2 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CTXN3Q4LDR2 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CTXN3Q4LDR2 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CTXN3Q4LDR2 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CTXN3Q4LDR2 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CTXN3Q4LDR2 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CTXN3Q4LDR2 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CTXN3Q4LDR2 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CTXN3Q4LDR2 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CTXN3Q4LDR2 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CTXN3Q4LDR2 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CTXN3Q4LDR2 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CTXN3Q4LDR2 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTXN3Q4LDR2 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTXN3Q4LDR2 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTXN3Q4LDR2 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTXN3Q4LDR2 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTXN3Q4LDR2 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTXN3Q4LDR2 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CTXN3Q4LDR2 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTXN3Q4LDR2 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTXN3Q4LDR2 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTXN3Q4LDR2 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTXN3Q4LDR2 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTXN3Q4LDR2 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTXN3Q4LDR2 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTXN3Q4LDR2 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTXN3Q4LDR2 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTXN3Q4LDR2 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTXN3Q4LDR2 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTXN3Q4LDR2 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTXN3Q4LDR2 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTXN3Q4LDR2 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTXN3Q4LDR2 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CTXN3Q4LDR2 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTXN3Q4LDR2 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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