Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 DCUN1D4-201ENST00000334635 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC12.51□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 AC004899.2-201ENST00000622993 3860 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
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SP6Q3SY56 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
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SP6Q3SY56 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
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SP6Q3SY56 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
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SP6Q3SY56 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
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