Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ6

KLHL38, Kelch-like protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL38Q2WGJ6 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms